进出口代理公司在代理进出口行业主要的收益在于:
①针对没有进出口权、进出口单证资质的企业或者个人，受其委托，办理进出口业务，从中为当事人提供各种代理服务，收取进出口代理手续费。包括进出口货代物流、报关代理、报检代理等服务费。一般，进出口代理费是进口总货值的百分之一。
②进出口代理费收费的衡量标准1、商品类型2、商品数量3、贸易额4、结算方式（L/C,T/T,D/P）5、贸易国别6、担保模式（保证金，抵押）
③进出口代理公司拥有各行业的企业信息，增加额外的资源盈利。
④对于批量集中的客户资源比如物流、金融、保险等开展资源整合，可以达到低价折扣，节省资金，赚取规模利润。

进出口公司针对不同的进出口商品涉及的进出口代理费的收取也不尽相同。可能会在进出口代理过程中出现繁琐的操作环节，涉及相应的费用。但是，正规的进出口代理公司都会在客户进出口业务完毕后给出详细的费用清单，以方便客户查验相应的费用支出。